サービス仕様
- シーケンシング：NovaSeq X Plus
- 納品データ：fastqファイル形式
- 納品方法：データダウンロード（100 Gb未満）/HDD納品（100 Gb以上）
ライブラリー調製方法
mRNAをキャプチャー後に、NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit for Illuminaでライブラリーを調製します。
サンプル要件
- RNA量：200 ng以上（total RNA） ＊血液サンプルの場合は400 ng以上（total RNA）
- 濃度：20 ng/µL以上
- 液量：10 µL以上 ＊血液サンプルの場合は20 µL以上
- RIN値：4.0 以上 ＊血液サンプルの場合は5.8以上
- 純度：OD260/280 = 2.0以上
OD260/230 = 2.0以上
RNAの分解、DNAのコンタミがないこと
※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。
納期
- サンプルQC合格後20営業日
データ解析（オプション）
■標準データ解析（リファレンスあり）
■定量データ解析（リファレンスあり）
■定量データ解析（リファレンスなし/De novo）
■クリーンデータ
クリーンデータ（CatNo. NV-CLEAN）をご依頼いただくと、以下の作業を行います。
- オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去
- 低質リード（Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード）の除去
※Qphred=-10log10（e）塩基配列識別の正確性を示す単位 - 塩基配列不明（N）が10％を超えるリードの除去
＊クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。
＊クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。
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