ChIPシーケンス

ChIPシーケンス

 

■サービス仕様

• シーケンシング：NovaSeq X Plus
• 納品データ：fastqファイル形式
• 納品方法：データダウンロード（100 Gb未満）/HDD納品（100 Gb以上）

 

■ライブラリー調製方法

• NEBNext ChIP-Seq for illumina

 

■サンプル要件

• DNA量：50 ng以上
• 濃度：2 ng/µL以上
• 液量：15 µL以上
• 純度：OD260/280 = 1.8 ~ 2.0
  DNAの分解、RNAのコンタミがないこと

※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。

　記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

 

■納期

• サンプルQC合格後35営業日

 

 

【データ解析（オプション）】

 

■ChIPデータ解析

• 解析メニューは＞＞こちら
• 納品データ見本は＞＞こちら

 

■クリーンデータ

クリーンデータ（CatNo. NV-CLEAN）をご依頼いただくと、以下の作業を行います。

 

1. オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去
2. 低質リード（Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード）の除去   
   ※Qphred=-10log10（e）塩基配列識別の正確性を示す単位
3. 塩基配列不明（N）が10％を超えるリードの除去

 

＊クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。

＊クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。

NGS受託解析サービスのお問い合わせ・お見積りは＞＞こちら＜＜から承ります。