Olink® Reveal プロテオミクス解析サービス
Olink® Reveal Proteomics Analysis Service
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PEA法（Olink社）と次世代シーケンスを組み合わせることで、大量のタンパク質データを調べることが可能
特長
- Proximity Extension Assay（PEA）テクノロジーに基づくマルチプレックス型高スループットバイオマーカー解析プラットフォーム
- 1000種類以上のタンパク質を調べることが可能（ヒトサンプルの場合）
- 少ないサンプル量と短時間での高精度なタンパク定量が可能
- サンプルを発送すると抗体反応、シーケンス、解析まで一括対応
| プロテオミクス相乗りサービス（NV-OLINK-R-1） | プロテオミクスサービス86サンプルセット（NV-OLINK-R-2） |
|---|---|
| 10サンプル以上からご利用できるサービス | 86サンプルでご利用できるおまとめセット |
サービス仕様
- 抗体パネル：Olink® Reveal
- ライブラリー調製方法：Olink® Reveal
- シーケンサー：Novaseq X plus
- 納品データ：データファイル（NPXファイル形式）・解析結果
- 納品方法：データダウンロード（100 Gb未満）／HDD納品（100 Gb以上）
サンプル要件
| サンプルタイプ | サンプル量 | 保管/輸送状態 | その他 |
|---|---|---|---|
| 血清/血漿 | 50 µL以上 1.5 mLチューブに保管 |
輸送中にサンプルが解凍されるのを防ぐために、十分な量のドライアイスを同梱し、冷凍便で送付してください。 | サンプルは抽出後速やかに-80℃で保存してください。溶血は分析結果に影響を与える影響があります。 凍結と解凍の繰り返しは避けてください。 |
| その他の検体種類 | 脳脊髄液(CSF)、細胞・組織ライセートなど（詳細はお問い合わせください） | ||
データ解析および納品
- Olink® データ解析
| データフォーマット | |
|---|---|
| 標準解析内容 (WBI*) デフォルトの納品様式 |
Parquet形式のNPXファイル （発現差異解析、エンリッチメント解析、タンパク質相互作用解析などを含む） |
*With Bioinformatics Analysis
標準解析内容
| 標準解析 | ソフトウェア |
|---|---|
| 1. データ標準化および品質管理 (QC) 1.1 NPX分布のボックスプロット |
NPX™ Map CLI OlinkAnalyze |
| 2. タンパク質発現量解析 2.1 群間の主成分分析 (PCA) 2.2 全サンプルのクラスタリングヒートマップ |
OlinkAnalyze |
| 3. タンパク質発現差異解析 3.1 発現差異解析結果 3.2 発現差異タンパク質の統計解析 3.3 発現差異タンパク質のクラスター解析 |
OlinkAnalyze R package (ggplot) |
| 4. 機能解析 (Functional Analysis) 4.1 GOエンリッチメント解析 4.2 KEGGエンリッチメント解析 4.3 Reactomeエンリッチメント解析 4.4 タンパク質相互作用ネットワーク解析 |
ClusterProfiler Custom Script |
納期
- 約4～6週間