完全長RNAシーケンス

サービス概要

• ロングリードシーケンサー PacBio Revioにより完全長RNAシーケンスが可能に
• 従来のショートリードRNAシーケンスでは困難であった全てのアイソフォームのシーケンスを実現
• 新規アイソフォームの発見と遺伝子発現の定性的（5M HiFiリード）および定量的（10M HiFiリード）な解析が可能
• 従来法では20～40%しかアセンブルできなかったスプライシングバリアント（mRNAのアイソフォームの多様性）の全貌を解明しより正確な転写産物解析を提供
• 高精度かつコスト効率の良い完全長RNAシーケンスで新たな発見をサポート

ロングリードシーケンスを用いたIso-Seqによる完全長RNA-Seq解析

ショートリードシーケンス

ショートリードシーケンスでは、アイソフォームをシーケンスできない
スプライシングバリアントの20～40％しかアセンブルできない

スプライシングバリアントの一部分しか見えない

ロングリードシーケンス

Kinnex full-length RNA-seqにより
全てのアイソフォームがシーケンスされる

スプライシングバリアントの真の姿に迫る

サービス仕様

• シーケンサー：PacBio Revio
• 納品データ：BAMファイル形式
• 納品方法：データダウンロード（100 Gb未満）/HDD納品（100 Gb以上）

ライブラリー調製方法

• Kinnex full-length RNA kit

サンプル要件

• サンプルタイプ：Total RNA
• サンプル量：≥ 1.2 μg
• 液量：≥ 30 μL
• 濃度：≥ 40 ng/μL
• RIN(Agilent 2100)：≥ 6.5 with the smooth baseline
• 純度：A260/280:1.8-2.0　A260/230:1.3-2.5

完全長RNA-Seqに必要なリード数の目安

納期

• 解析なし⇒サンプルQC合格後30営業日
• 解析あり⇒サンプルQC合格後45営業日

データ解析

解析メニューは＞＞こちら