illumina NovaSeq Xシーケンスサービス

illumina NovaSeq X Sequence Service

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調製済みライブラリーをお送りいただくことで、Novaseq Xにてシーケンスリードを行う受託サービス。ご希望データ量に応じて、各サービスから選択可能

illumina NovaSeq X レーンシーケンス
「レーンシーケンス」は、調整済みライブラリーを送っていただくことで、“シーケンスリードのみ”を受託いただくサービスです。
レーンを貸し切りでシーケンスを行いますので、他のユーザー様のサンプルと相乗りはせず、1レーンで取得可能なデータ量を独占できます。
一度に多数のサンプルのシーケンスデータ取得を目的とされるユーザー様にオススメしております。


illumina NavaSeq X 1/2 & 1/4レーンシーケンス(相乗りシーケンス)
NavaSeq Xの1レーン(375 Gb)ではデータ量が多いユーザー様に、1/2(180 Gb)& 1/4(90 Gb)レーンシーケンスもご用意いたしました。
ご希望データ量に併せて、サービスをご選択いただければと存じます。
*1/2&1/4レーンシーケンスは、他のユーザー様との相乗りシーケンスとなります。


■サービス仕様

  • シーケンサー:illumina NavaSeq Xシーケンサー
  • リード形式:150 PE
  • リード数:約12.5億ペアリード
  • データ量:約375 Gb/lane
  • 納品データ:fastqファイル形式
  • データ納品方法:HDD納品

※上記リード数およびデータ量の数値は参考値です。保証値ではありません。

相乗りサービスの場合は、以下のデータ量となります。

  • 1/2 レーンプラン:約180 Gb
  • 1/4 レーンプラン:約90 Gb


■サンプル要件(全サービス共通)

サンプルタイプ:ライブラリー調製済みサンプル

  • 濃度:10 nM以上
  • 液量:20 µL以上
  • ライブラリーサイズ:320 bp~520 bp
  • 純度:単一のメインピークで複数のピークがないこと
       アダプターダイマーがないこと
       プライマーダイマーがないこと

*1レーンでシーケンスするサンプルを、1チューブにプーリングしてご依頼ください。
*ライブラリー調製からご依頼いただくことも可能です(別料金)。ご希望の場合はお問合せ下さい。


■レーンシーケンス(1レーン)の注意点 

  • poolingサンプル数が少ない場合(2~5サンプルなど)、index readが偏り、振り分けに支障が出る場合がございます。
  • poolingサンプル数について6検体以上をお勧め致します。
  • 5検体以下の場合、indexを1~2塩基ミスマッチを許容して頂き、委託先にて振り分けを実施致します。


■1/2&1/4レーンシーケンスサービス(相乗り)の注意点

サンプルについて:サンプルはプールした状態でお送りください。
         委託先でプールする場合は、追加費用が発生いたします。

index readについて:10 bpのdual Indexでシーケンスを実施致します。
           8 bpのindexは8 bpでトリミング致します。
           indexはUnique Dual index(UDI)をお勧め致します。

index情報について:相乗りシーケンスのため、事前にご提供いただくindex情報はお間違い無いようにご記入ください。もし、何らかの理由にてindexで振り分けできなかった場合でも、Undetermined readは納品することができません。

ライブラリーについて:自作アダプターなど、ライブラリー構造やサイズが特殊な場合は事前にご連絡ください。QCなど、途中の段階でサービス対応をお断りさせていただく場合がございます。

納期について:相乗りシーケンスのため、レーン買い取りの場合に比べて納品にお時間をいただく可能性がありますこと、ご承知おきください。


■納期
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