サービス仕様
- シーケンサー ：PacBio Revio（HiFi Sequencing）
- ライブラリー調製方法：SMRTbell prep kit 3.0
- 納品データ ：BAMファイル形式
- 納品方法 ：HDD納品
本サービスは、Cell単位でシーケンスを受託するサービスです。
相乗りシーケンスは対応ができません。
※PacBio Revioは、目安の取得データ量からゲノムサイズの大きな生物種に向いております。
※ゲノムサイズ10～100 Mbなどの小サイズでの対応につきましては、こちらのサービスもご検討ください。
【取得データ量について】
WGSの場合の目安データ量：60～90 Gb 程度（HiFi read)/cell
※サンプルの状態、生物種によっても取得できるデータ量は異なりますため、参考値であることご留意ください。
サンプル要件
| サンプルタイプ | DNA量 | Average Size | 液量 |
|---|---|---|---|
| gDNA | 7.1 µg 以上 | 20,000 bp 以上 | 10 µL 以上 |
電気泳動で確認した際に分解がなく、スメアが見られないこと。
※Average SizeはFemto Pulse System（Agilent社）を使用し、DNA断片を測定した際の平均の長さです。
納期
6～8週間前後
データ解析
- データ解析1（De novo Assemble）
- データ解析2（Gene Prediction/Annotation）
- データ解析A（Mapping、Variant call）
- データ解析B（SV/CNV）
※データ解析2を実施する場合、データ解析1の実施が必須となります。
※データ解析Bを実施する場合、データ解析Aの実施が必須となります。
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