KAPA Universal Adapter & UDI Primer Mixes
KAPA Universal Adapter & UDI Primer Mixes
イルミナプラットフォームでのシーケンスを目的としたライゲーションベースのアダプター。KAPA ユニークデュアルインデックス（UDI）プライマーミックスと共に使用し、DNAサンプルからユニークにラベル付けされたライブラリーを作製する事が可能
特長
KAPA Universal Adapter
- Illuminaプラットフォーム上の次世代シーケンシング（NGS）用の短いアダプター
- A-tailingステップの後、T-overhangsを付加し、ライブラリーフラグメントにライゲーションする
- サンプルバーコードは、ターゲットエンリッチメントに先立って、ライブラリー増幅ステップで組み込まれる
KAPA UDI Primer（ユニークデュアルインデックス）Mixes
- 最大384種類のインデックスに対応
- KAPA UDI Primer Mixは、フォワードプライマーとリバースプライマーを事前に混合した組み合わせ
プライマーには、イルミナシーケンサーのインデックスミスアライメント（「インデックスホッピング」）を軽減する ように設計された個別の8ヌクレオチドインデックスが含まれる。 - KAPA ユニバーサルアダプターと組み合わせて使用し、次世代シーケンシング（NGS）用に個々のDNAサンプルから一意にインデックスが付加されたライブラリーを生成
- 固有のインデックスを付加する事により、ターゲットキャプチャまたはクラスター生成の前にライブラリーをプールして、マルチプレックスシーケンスに適したライブラリー作製が可能
（また、KAPA Hyper Kit シリーズにも使用する事が可能）
KAPAアダプター選択ガイド
| 機能 |
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KAPA HyperPlex アダプター |
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|---|---|---|---|
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Universal Adapter (本製品) |
|||
| インデックス数 | 96 | 384 | |
| P5 + P7バーコードの数 | 96 + 96 | 384 + 384 | |
| lllumina社と同じインデックス配列 | いいえ(1) | いいえ(1) | |
| 全てのIllumina社シーケンサーに対応 （patterned / non-patterned flow cells） |
対応 | 対応 | |
| PCRフリーのライブラリー調製 | 対応 | ⾮対応 | |
| 分子バーコード | なし | なし | あり |
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対応しているライブラリー調製キット ・KAPA HyperPrep、KAPA HyperPlus |
メーカー検証済み メーカー検証済み 互換性あり(2) |
互換性あり メーカー検証済み メーカー検証済み |
互換性あり 互換性あり メーカー検証済み |
| KAPA Universal Enhancing Oligosとの互換性 | あり | あり | |
| アダプターの情報 |
Full length、15 µM、 4反応/アダプター(3) |
Truncated、15 µM、 1反応/アダプター(3) |
Truncated、33 µM、 1反応/アダプター(3) |
| キット構成 | ハードシェル96ウェルプレートで提供(4) | アダプターは、チューブで提供 プライマーミックスはハードシェル96ウェルプレートで提供(4) |
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| KAPA Adapter Dilution Buffer | 付属（1キットあたり25 mL） | 別売 | |
(1) KAPA ユニーク デュアルインデックス アダプター（KAPA UDI アダプター）およびKAPA UDIプライマーミックスに使⽤されている192および768のバーコード配列のセットは、Roche社の独占的なものであり、P5/P7それぞれのセット間で異なっています。
(2) 理論的には可能ですが、十分に検証されていません。
(3) アダプターの希釈が不要な場合、KAPA HyperPrep KitまたはKAPA HyperPlus Kitを使用して、それぞれ4回または1回のライブラリー調製を行うのに十分な量が提供されます。
(4) KAPA UDIプライマーミックスとKAPA UDI アダプターのプレートは、剥離可能なシール付きで出荷されます。交換⽤アルミシールは、プレート1枚につき3枚提供されます。
* KAPA HyperPlex アダプターおよびKAPA UDI アダプターはMethyl-seqアプリケーションとの互換性はありません。
※本製品（KAPA Universal Adapter & UDI Primer Mixes）とKAPA HyperPlus Kitの組み合わせでライブラリー調製する手順については、ドキュメントタブ内の製品評価試験データの後半でご紹介しています。