rRNA除去RNAシーケンス

rRNA除去＆ストランド特異的 RNAシーケンス

 

 

 

 

■サービス仕様

• シーケンシング：Novaseq X Plus
• 納品データ：fastqファイル形式
  ※ Read1とRead2それぞれ作成されますので、1サンプルにつき2つのファイルを納品いたします。
• 使用できるライブラリ調製キット
  ・TruSeq stranded Total RNA Kit with RiboZero Gold（ヒト・マウス・ラット）
  ・TruSeq stranded Total RNA Kit with RiboZero Plant（植物由来サンプル）
  ・TruSeq stranded Total RNA Kit with RiboZero Plus（ヒト、マウス、ラット、細菌、疫学サンプル）
  ・TruSeq stranded Total RNA Kit with RiboZero Globin（血液サンプル）
  ・TruSeq stranded Total RNA Kit, NEBnext rRNA depletion Kit(Bacteria) （細菌サンプル）

• 取得合計データ量が100 G base 未満の場合は、基本はクラウド納品となります。

  取得合計データ量が110 G base 以上になった場合は、HDDでの納品となります。

  また、解析ありの場合は、取得合計データ量が56 G base以上になった場合、HDDでの納品となります。

 

■サンプル要件

• RNA量：0.5 µg以上（total RNA）
• RIN値：7以上
• rRNA比：1以上

※ Sample QC（Quality Check）の際に、Sampleを2-3 µL使用します。

　 Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

 

■対応できる解析メニュー

• Expresion Profile　　
• Expresion Profile、DEG
• Pathway解析（KEGG Enrichiment Analysis）
• Fusion Gene Prediction Results
• RNA-Seq De novo Assemble+Annotation
• De novo RNA-Seq Expresion Profile、DEG

※ 比較解析パターン数によっては、追加費用が発生する場合があります。

※ サンプルの⽣物種によっては対応できない場合もあります。

 

■納期

• サンプルQC合格後6週前後

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