フォーマピュア XL Total

特長

• 高完全性：他社製品より分解の少ないRNA
• 高品質：次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA
• 高収量：同一サンプルからDNAとRNAの両方を収量よく抽出
• 簡便な実験：SPRI磁性ビーズによるDNA/RNA抽出ワークフロー

概要

図１）高完全性：他社製品より分解の少ないRNA

図１）各がん組織由来のFFPEから抽出したRNAの完全性（RNAの分解程度）比較
FormaPure XL Total、他社カラム式抽出キットを使用して、乳がん、大腸がん、肝細胞がん、肺がん由来の10 µm FFPE組織切片各1枚からRNA抽出を行いました。RNAの完全性の評価には、Fragment Analyzer (Advanced Analytical) を使用しました。
各がん組織からFormaPure XL Totalで抽出したRNA（青色）は、他社カラム式抽出キット（オレンジ色）よりフラグメントサイズが大きく、分解の少ないRNAの抽出が可能であることを示します。DV200の値は、200 ntを超えるRNA量のパーセンテージを示します。 

表１）高品質：次世代シーケンスに求められる品質に適合するDNA

表１）FormaPure XL Totalで抽出したDNAで次世代シーケンスを行った際の、低頻度バリアントの検出例
FormaPure XL Totalで抽出したDNAをサンプルとして次世代シーケンス解析を行った結果、低頻度バリアント（変異）も安定して検出可能であることがわかります。
FormaPure XL Totalは、FFPE組織からのDNA抽出時にバイアスがかかりづらい特徴があり、次世代シーケンスのDNAサンプル調製に適していることを示します。

表２）高収量：同一サンプルからDNAとRNAの両方を収量よく抽出

表２）さまざまな保存年数およびがん由来の10 μm FFPE組織切片からの核酸収量
核酸定量は、それぞれPicoGreen (DNA), RiboGreen (RNA) 蛍光測定により行いました。
FormaPure XL Totalは、乳がん、肝細胞がん、肺がん、胃がん、結腸がん由来の長期保存FFPE組織からでも、高収量でDNAとRNAを抽出可能であることを示します。

図２）簡便な実験：SPRI磁性ビーズによるDNA/RNA抽出ワークフロー

図２）FormaPure XL TotalのDNA/RNA抽出ワークフロー

1. 80℃で脱パラフィン
2. 55℃で組織溶解／脱クロスリンク
3. RNA抽出用サンプルの取り出し
4. 核酸の磁性ビーズへの結合
5. 80%エタノール洗浄
6. DNase I 処理
7. RNAの磁性ビーズへの再結合
8. 80%エタノール洗浄
9. 精製RNAの溶出
10. 80℃で追加の脱クロスリンク
11. DNA抽出用サンプルの取り出し
12. RNase A 処理
13. DNAの磁性ビーズへの結合
14. Washでの洗浄
15. 80%エタノール洗浄
16. 精製DNAの溶出

キット内容

• Mineral Oil
• Lysis LBD (FormaPure XL Totalの場合)
• Lysis LBA (FormaPure Totalの場合)
• Bind BBA
• Wash WBA
• Re-Bind RBA
• RNase A
• Proteinase K

関連製品

• FormaPure Total
• FormaPure DNA
• FormaPure XL DNA
• FormaPure XL RNA