- お客様事例
10^5個のメダカ胚由来細胞を用いた in situ Hi-C Seq
東京大学大学院 理学系研究科 生物科学専攻 動物発生学研究室
熊谷 真彦様、武田 洋幸 様
お客様のコメント
KAPA Hyper Prep Kitは精製ステップが少なく、時間と手間が省け、簡便であった。
概要
【Cat.No. KK8500、KK8502、KK8504】
次世代シーケンサーの性能が向上し、汎用性が広がると共に、様々な分野における新たな解析アプリケーションとして、多くの手法が開発されてきている。
染色体の３次元立体構造を解析する手法として開発された3C（chromosome conformation capture）は、染色体の近接したDNA領域の検出を可能とする。
この3Cの手法を発展させた dilution Hi-C Seq法を用いることで、これまでにメダカ胚由来10^7個の細胞まで、また、更に改良された in situ Hi-C Seq法(現行法) を用いることで、10^6個の細胞まで解析することが可能であった。
今回、微量サンプル（1 ng ～）からライブラリー調製が可能なKAPA Hyper Prep Kitを用い、10^5個の細胞で解析を試みたので、それについて報告する。
