- お客様事例
BluePippinを用いた長鎖ライブラリーのサイズセレクションによるPacBioシークエンス長の改善
国立がん研究センター研究所 がんゲノミクス研究分野
新井 康仁 様
お客様のコメント
長鎖のDNA断片を効率的にシークエンスすることができた。
概要
【Cat.No. BLU0001】
現在の主要な次世代シークエンサーにおいては、一般的に短いライブラリーほど優先的にデータが得られやすいため、相対的に長いライブラリーのデータは得られ難くなる。
この場合、「サイズセレクション」により、不要な短いライブラリーを除去し、目的サイズのライブラリーを分画回収することで、より効果的に目的のデータを得ることが可能となる。
今回、スメアなヒトゲノムDNAサンプルから作製したPacBio用SMRTbellライブラリーについて、自動DNA断片ゲル抽出システムBluePippinを用いて4 kb以上の長鎖ライブラリーを分画回収することで、シークエンス長が改善可能か、検証した。
