特長
KAPA EvoPrep キットは、長年培われてきたHyperPrepの技術と次世代シーケンスのノウハウを基に新しく改良されたライブラリー調製キットです。
新たに改良された「KAPA EvoT4 DNA リガーゼ」が導入され、セルフリーDNAやFFPE DNAのような難しいとされているサンプルからでもライブラリー調製が可能となりました。
困難なサンプルにも対応
- cfDNAやFFPEのような難しいサンプルでもクオリティーの良いデータを得ることが可能
- 幅広いDNAインプット（0.1 ng～500 ng）で微量サンプルからでもライブラリー調製が可能 (PCRフリーの場合、50 ng～)
操作が簡単になり、作業時間が短縮
- Ready Mixタイプで操作が簡単
- 自動化にも対応したプレートタイプのラインナップも導入
- 操作が簡単になる事で、ヒューマンエラーのリスクを低減
- Ligationの時間がわずか5分で、トータル所要時間が短縮
ライブラリー収量の向上と優れたシーケンス品質
- KAPA EvoT4 DNA リガーゼにより、ライブラリーの変換効率が向上
- 高感度で確実なバリアント検出が可能
- シーケンシングアーティファクトを最小限に抑えたユニーク性の高いライブラリー調製が可能
- ターゲットエンリッチメントのワークフローでも優れたパフォーマンスを実現
シンプルなワークフロー
① End Repair&A-tailingとAdapter Ligationの試薬がReady Mixタイプになり、酵素とBufferの混合が不要
② Ligation Ready Mixには新しいKAPA EvoT4 DNA リガーゼが採用され、ライブラリー収量が向上
➂ 自動化に対応したプレートタイプの試薬のラインナップも追加
図1：KAPA HyerPrep Kit (左)とKAPA EvoPrep Kit (右)のワークフロー比較
ライブラリー収量がUP
- 様々なインプットDNA量で高いライブラリー変換効率を実現
- ダウンストリーム処理における増幅サイクルが少なくてすむので、重複率が低く、シーケンスカバレッジが高い
- KAPA Unique Dual-Indexed Adapter Kitを使用すればPCRフリーでの調製も可能 (最小インプット量：50ng～)
図2：KAPA HyerPrep Kit (左)とKAPA EvoPrep Kit (右)のLibrary収量比較
KAPA EvoPrep Kitを用いて作製したライブラリーは、すべてのインプット量でKAPA HyperPrep Kitよりも高い収量が得られた。
難しいサンプルでもLibrary調製が可能
- FFPEやcfDNAのような困難なサンプルタイプから、ユニークライブラリーの調製が可能
- cfDNAからでもユニーク分子が多く、データの信頼性が向上
- キメラリードの減少により、シーケンスアーティファクトの影響を低減
図3：各社Library調製キットの違いによるシーケンスデータ比較
サンプル：健常ヒト血漿由来cfDNA
インプット量：1 ng
使用した装置：NovaSeq6000、2x150bp
解析に使用されたデータ量：400Mクラスター（800Mリード）
シーケンスアーティファクトの減少
- シーケンスカバレッジの偏りを最小限に抑え、より均一なシーケンスカバレッジとシーケンスコストの削減を実現
- シーケンスメトリクスの改善により、シーケンスのアーティファクトが減少し、データの信頼性が向上
図4：シーケンス性能
サンプル：Human gDNA (NA12878)、コバリスでの断片化
インプット量：100 ng (PCRフリー)
使用した装置：NovaSeq6000、2x150bp
解析に使用されたデータ量：180Mクラスター（360Mリード）
Targert Capture法でのパフォーマンスとシーケンス結果
- 高い特異性と1000x以上の高いターゲットカバレッジを両立
- 高い均一性により、ディープシーケンスアプリケーションにおけるシーケンス効率を向上
図5：ターゲットキャプチャー法を用いたシーケンスデータ
サンプル：cfDNA
インプット量：10 ng
使用したパネル：KAPA HyperCap Oncology Panel (241 Kb)
使用した装置：NovaSeq6000、2x150bp
解析に使用されたデータ量：50Mクラスター（100Mリード）
仕様
| 互換性のあるプラットフォーム | すべてのイルミナシーケンサー |
|---|---|
| ライブラリータイプ | DNA |
| 出発物質 | 断片化DNA、cfDNA、FFPET DNA、PCR、アンプリコン |
| 投入量 | 0.1 ng～500 ng |
| キットの保管方法 | -15℃～-20℃ |
| 単品での販売もございます。 |
||||
| コンポーネント名 | KAPA End Repair and A-Tailing ReadyMix |
KAPA Ligation Ready-Mix |
KAPA HiFi HS Ready-Mix（2X） |
KAPA Library Amplification Primer Mix (10X) (無償添付) |
|---|---|---|---|---|
| キャップまたはプレートの色 | 青 | 黄 | 緑 | － |
| KAPA EvoPrep Kit / 10154039001 (24 rxn) | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 KK2623 |
| KAPA EvoPrep Kit / 10096039001 (96 rxn) | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 KK2623 |
| KAPA EvoPrep Kit / 10153849001 (384 rxn) | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 09420410001 |
| KAPA EvoPrep, 96 well plate / 10153865001 (プレートフォーマット) | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 09420479001 |
| KAPA EvoPrep Kit (PCR-free) / 10153806001 (24 rxn) | 〇 | 〇 | － | － |
| KAPA EvoPrep Kit (PCR-free) / 10153814001 (96 rxn) | 〇 | 〇 | － | － |
| KAPA EvoPrep Kit (PCR-free) / 10153857001 (384 rxn) | 〇 | 〇 | － | － |
| KAPA EvoPrep, PCR-free 96 well plate / 10154284001 (プレートフォーマット) |
〇 | 〇 | － | － |
| KAPA HiFi HS RM, 96 well plate / 09420444001（プレートフォーマット） |
－ | － | 〇 | － |
| KAPA Library Amplification Primer Mix (10X) / 09420479001 (プレートフォーマット) |
－ | － | － | 〇 |