Humanメチローム受託解析サービス

サービス概要

Human Methylome受託解析サービスでは、NGSを用いてヒトの組織検体や血しょう中セルフリーDNAなどリキッドバイオプシーから得られた微量サンプルの網羅的なDNAメチル化プロファイルを取得します。バイオマーカー探索やがん・神経変性・循環器・代謝性疾患のモニタリングに適しています。

独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得・解析を加え、結果をお手元にお届けします。

お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。

特長

• Human Methylomeパネルを用いることにより、メチル化バイオマーカーの同定を実現
• 398万箇所以上のCpGサイトを解析可能
• 123 Mbのパネルが、ヒトのCpGアイランドサイトの84％以上をカバー
• WGBSより高い費用対効果
• 高いカバレッジでデータ取得
• Twist Bioscienceの技術を活用

　

Human Methylome受託解析で高度なDNAメチル化検出を実現

サンプル処理から解析まで

最先端の酵素変換処理と、Twist社の高性能カスタムプローブによる均一なキャプチャにより、高いオンターゲット率で再現度の高い解析が可能です。

革新的なライブラリー調製

ライブラリーの複雑性とGCバランスが大幅に改善されており、より高いCpG検出率が得られています。また、サンプルダメージの低減に伴い、希少サンプルや難サンプルの使用が可能になりました。

ハイブリダイゼーション試薬の最適化

性能を落とさずにハイブリダイゼーションのタイミングを調整し、パフォーマンスを向上いたしました。また、メチル化DNAのハイブリダイゼーションエンハンサーを採用し、オンターゲット率が改善しています。

高効率のカスタムメチル化パネル

キャプチャープローブは管理された設計・合成・品質管理によって、均一性と再現性を最大化しており、センス、アンチセンス、メチル化および非メチル化 DNA を同時にキャプチャできます。あらゆるパネルサイズ、ターゲット領域、マルチプレックス要件に対して卓越したパフォーマンスを発揮します。

Humanメチローム解析の流れ

Step 1:

• ゲノムDNAの品質チェックとgDNAのせん断
• 断片化処理

Step 2: 

• 酵素的塩基変換
• ライブラリー構築と特異配列のキャプチャー

Step 3: 

• シーケンシング(Illumina社プラットフォーム使用)
• ペアエンド150 bp、サンプル当たり平均60 Mi raw reads – 理論カバレッジ >150 x

 

バイオインフォマティクス解析

多彩な追加解析オプションを取り揃えています。

スタンダード解析

• レファレンスゲノムへのアラインメント
• メチレーションコール
• アノテーション

アドバンス解析

• 示差解析
• 示差遺伝子のアノテーション
• 主成分分析
• GO解析
• パスウェイ解析

解析のカスタマイズ

機械学習解析など上記にない解析法をご希望の場合はお気軽にご相談ください。

受託解析サービスの流れ

1.  お問い合わせ・お見積り
   送付いただいたサンプルについて（専用フォームはこちら）の情報をもとにお見積を作成し、サービスガイドライン及び解析結果の見本、Biosafety formとともにお送りいたします。
   サンプル調製・送付ガイドラインを必ずご一読いただき、Biosafety formにサンプルの詳細をご記入ください（輸出可否の確認をさせていただきます）。
   ※サービスガイドライン等は下のリンクからもダウンロードしていただくことも可能です。
   ①サービスガイドライン
   Human Methylome_受託サービスガイドライン
   
   ②サンプル調製・送付ガイドライン
   Human Methylome_受託サービスサンプル提出ガイドライン
   
   ③Biosafety form
   Human Methylome Biosafety form
   
   
2. 注文書送付
   注文を受領した段階で『サンプルIDシート』をお送りいたしますので、ご記入の上ご返送ください。
   いただいた書類をもとに、分析するサンプルをご送付いただくスケジュールを調整・ご連絡いたします。
   
   
3. サンプル送付
   サンプル送付日が決定いたしましたら、サンプル調製・送付ガイドラインに従ってゲノムDNAサンプルをご準備いただき、弊社にお送りください。
   弊社で確認後、Diagenode SAにサンプルを送らせていただきます。
   
   
4. 解析作業
   ・サンプルの品質管理
   Qubit (Thermo Fisher)を用いて品質管理を行います。サンプルに不備があった場合はこの段階で追加のサンプル提供についてご相談させていただきます。
   ・gDNAのせん断、断片化処理
   ・酵素的塩基変換
   ・ライブラリー構築と特異配列のキャプチャー
   ・シーケンシング(Illumina社プラットフォーム使用)
   ・バイオインフォマティクスに基づく解析（一部オプション）
   
   
5. 納品物送付
   解析結果データの納品はDiagenode SAから直接お客様に電子メールでお送りいたします。
   容量の大きいファイルのダウンロードについてはftpサーバーよりダウンロードしていただく形になります。

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