Infinium メチレーションEPICアレイ受託解析サービス

サービス概要

Infinium Methylation EPIC Arrayは、バイサルファイト法を利用したゲノムワイドなDNAメチル化状態を解析できるIllumina社のソリューションで、ゲノム上のヒトCpG部位のメチル化状態を1塩基の分解能で定量することが可能です。

網羅的なヒトゲノム上メチル化DNAの手軽な解析方法です。

また、マウスゲノム上メチル化DNAの解析に対応したInfinium Mouse Methylation Array受託解析サービスの提供も開始いたしました。一般的な実験用マウスのモデル系統に対応可能です。

独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得・解析を加え、結果をお手元にお届けします。

お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。

特長

• 短納期かつ安価なソリューション
• CpG、非CpG、およびCHHサイトのメチル化領域の定量分析
• Differentially methylated site 解析
• エンドツーエンドのバイサルファイト処理、アレイハイブリダイゼーション、および解析
• 追加FFPE回収ステップにより、FFPEからのサンプルにも対応可能

NGS解析、バイオインフォマティクス及びメチローム、RNA-seqを含むマルチオミクスのモデリングにおける豊富な経験を基にサービスを提供します。

Infinium メチレーションEPICアレイ解析の流れ

Step: エンドツーエンドMethylationEPIC array工程

• バイサルファイト処理（塩基変換）
• 全ゲノム増幅
• アレイハイブリダイゼーション
• 1塩基伸長
• アレイスキャナによる読み取り

バイオインフォマティクス解析

多彩な追加解析オプションを取り揃えています。

提供データ

サンプルアノテーション、搭載CpGサイト情報、出力生データ

アドバンス解析

• 示差解析
• 示差遺伝子のアノテーション
• 主成分分析
• GO解析
• パスウェイ解析

解析のカスタマイズ

マルチオミクス解析など上記にない解析法をご希望の場合は弊社営業担当者にご相談ください。

受託解析サービスの流れ

1. お問い合わせ・お見積り
   送付いただいたサンプルについて（専用フォームはこちら）の情報をもとにお見積を作成し、サービスガイドライン及び解析結果の見本、Biosafety formとともにお送りいたします。
   サンプル調製・送付ガイドラインを必ずご一読いただき、Biosafety formにサンプルの詳細をご記入ください（輸出可否の確認をさせていただきます）。
   ※ガイドライン等は下記リンクからダウンロードしていただくことも可能です。
   ①サービスガイドライン
   EPIC Array_受託サービスガイドライン
   Mouse Methylation Array_受託サービスガイドライン
   
   ②サンプル調製・送付ガイドライン
   EPIC Array_受託サービスサンプル提出ガイドライン
   Mouse Methylation Array _受託サービスサンプル提出ガイドライン　
   
   ③Biosafety form
   Epic Array Biosafety form
   
   
2. 注文書送付
   注文を受領した段階で『サンプルIDシート』をお送りいたしますので、ご記入の上ご返送ください。
   いただいた書類をもとに、分析するサンプルをご送付いただくスケジュールを調整・ご連絡いたします。
   
   
3. サンプル送付
   サンプル送付日が決定いたしましたら、サンプル調製・送付ガイドラインに従ってゲノムDNAサンプルをご準備いただき、弊社にお送りください。
   
   
4. 解析作業
   ・サンプルの品質管理
   　Qubit (Thermo Fisher)を用いて品質管理を行います。サンプルに不備があった場合はこの段階で追加のサンプル提供についてご相談させていただきます。
   ・バイサルファイト処理
   ・メチレーション特異的PCRを用いたバイサルファイト変換の確認
   ・全ゲノム増幅
   ・アレイハイブリダイゼーション
   ・一塩基伸長反応
   ・アレイスキャナーによる検出
   ・バイオインフォマティクスに基づく解析（一部オプション）
   
   
5. 納品物送付
   解析結果データの納品はDiagenode SAから直接お客様に電子メールでお送りいたします。
   容量の大きいファイルのダウンロードについてはftpサーバーよりダウンロードしていただく形になります。

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