Targeted DNAメチレーション受託解析サービス
Target DNA Methylation Service
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全ゲノム上の既知・特定範囲のメチル化DNAの定量解析手法
サービス概要
全ゲノム上の既知・特定範囲のメチル化DNAの定量解析手法です。
Targeted DNA methylationによるメチル化解析は、解析したい範囲に応じいくつかの方法で行うことが可能です。
独自のワークフローを通してお客様のサンプルから高品質の分析データを取得・解析を加え、結果をお手元にお届けします。
お客様のご注文後、サンプル送付から処理、データ取得、解析を包括的にサポートします。
特長
- 透明性：お客様とのコミュニケーションを基にカスタマイズされたプロジェクト設計を実施
- 専門性：専任のデータサイエンティストがプロジェクトの成功をお手伝い
- アウトプット：包括的なデータ分析結果を出版品質の図表にまとめてご提供
NGS解析、バイオインフォマティクス及びメチローム、RNA-seqを含むマルチオミクスのモデリングにおける豊富な経験を基にサービスを提供します。
的を絞ったメチル化解析に
- 部位特異的なDNAメチル化パターンの解析
- 1塩基単位の解像度
- 高い感度・特異性をトータルのコストでお得に実施
- レアバリアントの解析に極深度シーケンスの実施も可能
- エピゲノムバイオマーカーの確認に最適
Targeted DNAメチレーション解析の流れ
解析したい範囲・対象に応じて異なる分析方法を選べます。
| Bisulfite Amplicon Sequencing (BSAS) | カスタムキャプチャープローブ |
|---|---|
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| バイサルファイト処理を行ったゲノムDNA上のターゲット領域をPCRで増幅し、得られたアンプリコンからライブラリーを調製して次世代シーケンシングを行います。 アンプリコンを得る過程でPCRプライマー配列と反応条件決定を行います。次世代シーケンスはIlluminaプラットフォームを採用しています。全生物を対象に行えます。 いくつかのCpG領域を含む長いDNA（～200 kb）を解析するのに適しています。 |
断片化したゲノムDNA上のターゲット領域をRNAプローブ（Agilent SureSelect）を用いて配列選択的にキャプチャーします。単離した配列を対象にバイサルファイト処理を行い、次世代シーケンシングで解析します。 次世代シーケンスはIlluminaプラットフォームを採用しています。全生物を対象に行えます。 ターゲットとなるCpG領域を含む長いDNA（200 kb～24 Mb）を解析するのに適しています。 |
バイオインフォマティクス
| Bisulfite Amplicon Sequencing (BSAS) | カスタムキャプチャープローブ | |
|---|---|---|
| アウトプットファイル |
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オプションでメチル化の示差的解析を行うことも可能ですので、詳細はお問い合わせください。
受託解析サービスの流れ
- お問い合わせ・お見積り
送付いただいたサンプルについて（専用フォームはこちら）の情報をもとにお見積を作成し、サービスガイドライン及び解析結果の見本、Biosafety formとともにお送りいたします。
サンプル調製・送付ガイドラインを必ずご一読いただき、Biosafety formにサンプルの詳細をご記入ください（輸出可否の確認をさせていただきます）。
※ガイドライン等は下記リンクからダウンロードしていただくことも可能です。
①サービスガイドライン
Targeted DNA methylation 受託サービスガイドライン
②サンプル調製・送付ガイドライン
Targeted DNA methylation サンプル提出ガイドライン
③Biosafety form
Targeted NGS BS Biosafety form - 注文書送付
注文を受領した段階で『サンプルIDシート』をお送りいたしますので、ご記入の上ご返送ください。
いただいた書類をもとに、分析するサンプルをご送付いただくスケジュールを調整・ご連絡いたします。 - サンプル送付
サンプル送付日が決定いたしましたら、サンプル調製・送付ガイドラインに従って分析するサンプルをご準備いただき、弊社にお送りください。 - 解析作業
・ゲノムDNAの品質管理
・（または細胞・組織からのDNA抽出）
・PCR条件の検討と増幅
・ライブラリー調製と品質管理
・次世代シーケンシング
・バイオインフォマティクスに基づく解析 - 納品物送付
オプションで追加される解析結果データの納品はDiagenode SAから直接お客様に電子メールでお送りいたします。
容量の大きいファイルのダウンロードについてはftpサーバーよりダウンロードしていただく形になります。