KAPA HyperChoice Kit（ヒト⽤カスタムエンリッチメントキット）

KAPA HyperChoice Kit

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よくあるご質問2件

SeqCap EZシリーズで長年培われ蓄積されたオリジナルのプローブデザインアルゴリズムと、ハイブリッドキャプチャーテクノロジーを組み合わせることで、さまざまなメリットをご提供

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KAPAターゲットエンリッチメントキットの発売に合わせてKAPA HyperCapワークフローがVer3.0にアップグレード
ストリームラインワークフローによるステップの簡略化で、ライブラリ―調製からシーケンスまでの時間を短縮
ライブラリー調製の翌日午前中からシーケンスランが可能
（ハイブリダイズのインキュベーション時間を含む）

カスタムデザインは、より小さなターゲットサイズ（500 kb～）にも対応できるようラインナップを追加
最大16サンプルまでのマルチプレックスキャプチャー*にも対応
これによりキャプチャーコストの大幅な削減が期待できます。
＊プレックス数はアッセイに必要なカバレッジやターゲットサイズ、シーケンスデータ量により変動します。

詳しくは弊社までお問合せください。

HyperDesignツールは、誰でも簡単にプローブデザインが作成できるよう、シンプルで分かりやすくインターフェースが設計されています。
プローブデザインが初めての方や、専門の知識をお持ちでない方でも安心してご利用いただけます。
たったの5ステップで完了し実験がスタートできます。

KAPA HyperChoice遺伝性疾患パネルは、遺伝性疾患に関連する4,100以上の遺伝子と領域をカバーし、
Roche Sequencingと「DallasChildren'sHospital」の研究者が共同で設計しております。

※各詳細は、ドキュメントタブ内「技術情報」からファイルをそれぞれご確認ください。

【KAPA HyperChoice　BRCA1 Panel 】（IRN：1000004843　KAPA HyperChoice MAX 0.5Mb T1）
BRCA1遺伝子領域を対象とした遺伝子パネル

ゲノムアセンブリは、ヒトゲノムビルドGRCh38に基づいています。
「プライマリターゲット」（元のCDS領域とClinVarから予測される病原性SNP）および「キャプチャターゲット」（キャプチャプローブフットプリント）のターゲットを示すデザインファイルが含まれています。
設計ターゲットと重複する遺伝子は、両方のBEDファイルの4列目に提供されています。
合計デザインサイズは、8.8 kbのプライマリターゲットと10.0 kbのキャプチャターゲットです。

【Inherited Disease Panel】（IRN：1000004873　KAPA HyperChoice MAX 40Mb）
遺伝性疾患を対象とした遺伝子パネル

ゲノムアセンブリは、ヒトゲノムビルドGRCh38に基づいています。
「プライマリターゲット」（小さな領域のサイズが20 bpに拡張された元の領域）と「キャプチャターゲット」（キャプチャプローブのフットプリント）のターゲットを示すデザインファイルが含まれています。
設計ターゲットと重複する遺伝子は、両方のBEDファイルの4列目に提供されています。
合計デザインサイズ（hg38）は、10.1 Mbのプライマリターゲットと12.3 Mbのキャプチャターゲットです。

【Sudden Cardiac Death Panel 】（IRN：1000004863　KAPA HyperChoice MAX 3Mb T3）
心臓突然死を対象とした遺伝子パネル

ゲノムアセンブリは、ヒトゲノムビルドGRCh38に基づいています。デザインは200の遺伝子をカバーしています。
「プライマリターゲット」（元のCDS領域とClinVarから予測される病原性SNP）および「キャプチャターゲット」（キャプチャプローブフットプリント）のターゲットを示すデザインファイルが含まれています。
設計ターゲットと重複する遺伝子は、両方のBEDファイルの4列目に提供されています。
4つの遺伝子（KCNH2、KCNQ1、MYBPC3、PKP2）には、コピー数多型の検出を支援するために、遺伝子の長さに沿って追加の分散ターゲットがあります。
合計デザインサイズは、543 kbのプライマリターゲットと772 kbのキャプチャターゲットです。

【KAPA HyperChoice　mtDNA design】（IRN：1000005603　KAPA HyperChoice MAX 0.5Mb T1）
ミトコンドリアDNAを対象としたデザインプローブ

【KAPA HyperCap DS NHL Panel 】（IRN:10000028225、KAPA HyperChoice MAX 3Mb T1）
悪性リンパ腫(非ホジキンリンパ腫)の高感度遺伝子変異のモニタリングのための研究用パネル

血中ctDNAを高感度に検出し、自施設で経時的な解析を行なう事が可能です。
NHLに関連する383遺伝子(遺伝子全体または一部)と追加の遺伝子間領域の合計341 Kbをカバーしています。
ハイブリダイゼーション法をベースとしたKAPA HyperCap ワークフローと、オープンソースのバイオインフォマティクス解析ツールを組み合わせて使用します。
遺伝子変異の高感度検出と経時的解析を目的とするため、主にSNVを検出するようなデザインとなっております。
専門家が選択した遺伝子や領域を1つのパネルにすることで、複数のNHLサブタイプに対応しております。
ctDNA検出、MRD解析、細胞起源決定のような様々な研究に応用可能です。予後バイオマーカーとしてのctDNAを検証した第3相POLARIX研究で使用されたパネルデザインです。