先染めゲルを用いて電気泳動した際に低分子側のマーカーが薄くなる。原因と対処法を教えてください。

ミドリグリーンアドバンスは構造にプラスチャージを持つため、電気泳動を行うとDNAと逆方向に引っ張られるため、次第にDNAから剥離していきます。

低分子側ではこの現象が起こりやすい為、泳動とともに検出しにくくなります。

 

対処法としては以下の3つの対処法をお試しください。

① 泳動時間の短縮

② 泳動後の後染め染色法の実施

③ 電気泳動層の＋極（低分子側）のバッファーへのミドリグリーンアドバンスの添加