RPAプライマーの長さと、得られるアンプリコンのサイズの最適値を教えてください。

プライマーは30～35ヌクレオチド長が推奨です。アンプリコン長は80 bp以上が求められ、理想は100～200 bpです。その他推奨条件は、以下に記載いたします。

■プライマー条件

・30～35ヌクレオチド長

・GC含量は40%～60%

・長いホモポリマーのトラックを含まない

・直列反復配列、逆反復配列、パリンドローム（回文配列）などが少ない

・アンプリコン長の理想は100～200 bp・プローブを使用する場合、Forward Primerは、5 bp Probeと重ねる。うまくワークしない場合は、5 bpずつずらしていく。 対してReverese PrimerはProbeと重ねてはいけない。

詳細については、TwistAmp®シリーズマニュアル - 補足資料(Appendix)をご参照ください。

【最終更新日：2024年10月18日】