Q
こちらの製品で増幅したPCR産物はダイレクトシーケンスも可能でしょうか? 色素が入っていると何か影響はありますでしょうか?
PCR反応液をそのままダイレクトシーケンスにご使用いただける可能性はございますが、色素の有無にかかわらず、Kapa社としては、PCR後に反応液をダウンストリームアプリケーションにご使用いただく場合、基本的には、核酸精製キット等で精製いただくことをお勧めしております。
そのほうが、ダウンストリームにおいて常に最適条件で安定的な結果が得られるためです。
(また、KAPA社でダイレクトシーケンスへの検証を実施していないとのことです。)
<補足のご説明>
本キットに含まれる色素については、もともとPCR酵素反応を阻害しない色素として選別された独自の色素となっております。
このため、例えダイレクトシーケンスにそのままご使用いただいた場合でも、色素そのものがサイクルシーケンス反応に影響することはないとのことです。
ご参考までに、お客様の中には、実際に色素入りのPCR試薬の反応液を用いてダイレクトシーケンスを数百ラン以上実施し(ABI3130使用)、
何の問題もなくシーケンスが可能であったとの内容を確認しております。