試薬を調製後に、プレヒートの時間をスキップして、すぐに反応を開始したいです。この運用を行うために、PCRサイクルの最初の反応開始前にランを、自動で一時停止することは可能ですか？

設定可能です。
以下の手順に従い設定してください。

 

1. プログラム作成時に、一番最初の温度（機器上画面上ではSegment ）を選択し、「Extented Parameter」を開く
2. 「First Segment Pause」の設定のカーソル部分をタップし、カーソルを右にずらす

 

上記の設定をすることで、ラン開始時に最初の設定温度まで達した際に、自動的に一時停止状態となります。
また、チューブをセットした後に、画面下側の「Continue」ボタンをタップしていただければ、RUNは再開されます。