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ピッピンプレップ

(Pippin Prep)

Sage Science

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製品概要

次世代シーケンサー用DNAフラグメント調製に最適!

特長

  • 煩雑なマニュアルでのゲル抽出操作が不要となり、実作業時間の短縮を実現します。
  • より狭い分布のDNA断片の抽出が可能です。
  • 低分子DNAのコンタミを減少させることで、無駄なリードや不明瞭な判定を減らし、シークエンス効率がアップします。
  • ゲルカセットの各レーンが独立しているため、泳動中の拡散によるサンプル間のコンタミリスクが発生しません。
  • メーカー保証期間: 2年間

Pippin シリーズが有用な次世代シークエンスアプリケーション

  • ペアエンドシークエンスライブラリー作製
  • ChiP-Seqライブラリー作製
  • miRNAライブラリー作製

ゲルカセット各種

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ゲルカセット


目的のサイズレンジ
3.0% アガロース 100bp - 250bp
2.0% アガロース 100bp - 600bp
1.5% アガロース 250bp - 1.5kb

 

参考文献

Naomi Park* et al,
An improved approach to mate-paired library preparation for Illumina sequencing,
Methods in Next Generation Sequencing. Volume 1, Pages 10–20, ISSN (Online) 2084-7173, DOI: 10.2478/mngs-2013-0001, July 2013

*Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, UK.
「Illumina社次世代シーケンシングにおけるメイトペア・ライブラリー調製法の改良」

<リンク先>
この論文のリンク先はこちらになります。このページから直接ダウンロードできます。

関連製品

  • 本製品用アガロースゲルカセット の詳細はこちら
  • 1.5kb以上のより長いDNAフラグメントの回収が可能な Blue Pippin の詳細はこちら

関連情報

  • Pippin family のアプリケーションとプロトコルはこちら (Sage Scienceのウェブサイトへリンクします)
  • PippinPrepがBioo社製品small RNA Sequence Kitのプロトコルで推奨されました。
      製品ページはこちら
      プロトコルPDFはこちら

保証期間延長サービス

当製品は保証期間を一年単位で延長するサービスをご利用いただけます。

詳細は下記をご覧ください。

▶▶ 保証期間延長サービス

仕様

仕様 Blue Pippin Pippin Prep
泳動方式 定電圧電気泳動
パルスフィールド電気泳動
定電圧電気泳動
泳動時間(目安)
(目的サイズによって異なります)
30分~10時間 50分~3時間
最大サンプル添加量 5μg(断片化gDNA)

5μg(断片化gDNA)



本体仕様 Blue Pippin Pippin Prep
使用電源 100-240V(Constant) 2.5A / 50-60Hz
蛍光検出 励起波長:470nm 励起波長:535nm
検出波長:525nm 検出波長:640nm
寸法 W 280 x D 530 x H 180mm
重量 7kg

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納期/出荷日について

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※冷凍品(-20℃)に関しては、原則として休前日(金曜日など)の出荷を行っておりませんのでご了承ください。(一部販売店様向けを除く)

CatNo. メーカーコード・旧型番 概要 単位 価格 在庫
PIP0001 PippinPrep本体 (17インチモニター、キーボード、マウス付属) 1 お問い合わせください 受注発注品 返品不可

EC going 及び BPM購入システムとは?
EC going FAQ

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アプリケーションノート

取扱説明書

レビュー

5 4件のレビュー

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5.0

2019年06月24日

リード数(passed filter wells)と平均リード長が向上

PippinPrepで高分子DNAを除去する事により、リード数(passed filter wells)と平均リード長が向上しました。
コントロールビーズのシーケンス結果を考慮しても、PippinPrepでの高分子除去は、総解読量(total bases)の向上に効果的と考えられます。

(日本ジェネティクスより)
こちらのお客様の事例(アプリケーションノート)は下記よりダウンロードしてご覧頂けます。

「高分子DNA除去によるリード数の向上」
⇒ ダウンロードはこちら

独立行政法人 国立国際医療研究センター 肝炎・免疫研究センター 杉山真也様

5.0

2019年06月24日

精度と再現性が高かった

PippinPrepで分画したライブラリーの方が、精度と再現性が高かった。
機器操作も非常にシンプルで直感的に使用できるのが良い。

(日本ジェネティクスより)
こちらのお客様の事例(アプリケーションノート)は下記よりダウンロードしてご覧頂けます。

「次世代シーケンス用DNA断片の再現性高い サイズセレクション(C社との比較)」
⇒ ダウンロードはこちら

独立行政法人 製品評価技術基盤機構 バイオテクノロジーセンター バイオ安全技術課様

5.0

2019年06月24日

抽出サンプルの回収純度および効率が非常に良かった

PippinPrepはC社抽出装置よりも回収率は約3割高くなり、抽出サンプルの回収純度および効率が非常に良かった。
ゲル切出しよりも大幅な作業時間の短縮を可能にしてくれます。得られるDNAサイズの再現性も高く、安定したシーケンシングが大いに期待できます。

(日本ジェネティクスより)
こちらのお客様の事例(アプリケーションノート)は下記よりダウンロードしてご覧頂けます。

「NGSライブラリーRNA断片の再現性高いサイズセレクション」
⇒ ダウンロードはこちら

理化学研究所オミックス基盤研究領域 受託解析サービス(GeNAS) 樽井様

5.0

2019年06月24日

最新の400bpシークエンスでもよい結果がでています

Ion Torrent PGMのシークエンステンプレート調製におけるエマルジョンPCRはライブラリーのインサート長に非常に敏感で、短い断片が混入したり、インサート長が指定より長い場合に目的のライブラリー分子が正しく増幅されず、期待通りのシークエンス結果が得られないことがあります。PippinPrepによる正確なサイズ分画はPGMの能力を十分活用するためには必須だと思います。最新の400bpシークエンスでもよい結果がでています。

(日本ジェネティクスより)
こちらのお客様の事例(アプリケーションノート)は下記よりダウンロードしてご覧頂けます。

「Ion Torrent PGM用ライブラリー調製における正確なサイズセレクションの有用性」
⇒ ダウンロードはこちら

沖縄科学技術大学院大学 DNAシーケンシングセクション 小柳 亮様

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