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サンプル要件情報SAMPLE

  • RNAシーケンス

    mRNAシーケンス
    RNA量 200 ng以上（total RNA）
    ＊血液サンプルの場合は400 ng以上（total RNA）
    濃度 20 ng/µL以上
    液量 10 µL以上
    RIN値 4.0 以上
    純度 OD260/280 = 2.0以上
    OD260/230 = 2.0以上
    RNAの分解、DNAのコンタミがないこと。

    ※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
    　記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

    微量 mRNAシーケンス
    RNA量 0.01 µg以上（total RNA）
    RIN値 7以上
    rRNA比 1以上

    ※Sample QC（Quality Check）の際に、Sampleを2-3 µL使用します。
    　Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

    ストランド特異的RNAシーケンス
    RNA量 0.8 µg以上（total RNA）
    濃度 50 ng/µL以上
    液量 20 µL以上
    純度 OD260/280 = 2.0以上
    RNAの分解、DNAのコンタミがないこと。

    ※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
    記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

    rRNA除去＆ストランド
    特異的RNAシーケンス
    RNA量 0.5 µg以上（total RNA）
    RIN値 7以上
    rRNA比 1以上

    ※Sample QC（Quality Check）の際に、Sampleを2-3 µL使用します。
    　Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

    原核生物RNAシーケンス
    RNA量 500 ng以上（total RNA）
    濃度 50 ng/µL以上
    液量 10 µL以上
    RIN値 6.0 以上
    純度 OD260/280 = 2.0以上
    OD260/230 = 2.0以上
    RNAの分解、DNAのコンタミがないこと。

    ※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
    　記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

    small RNAシーケンス
    RNA量 2 µg以上（total RNA）
    濃度 50 ng/µL以上
    液量 20 µL以上
    RIN値 7.5 以上
    純度 OD260/280 = 2.0以上
    OD260/230 = 2.0以上
    RNAの分解、DNAのコンタミがないこと。

    ※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
    　記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

  • DNAシーケンス

    微生物全ゲノムシーケンス

    <微生物全ゲノムシーケンス>

    RNA量 300 ng以上
    濃度 15 ng/µL以上
    液量 20 µL以上
    純度 OD260/280 = 1.8 ~ 2.0
    DNAの分解、RNAのコンタミがないこと。

    ※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
    　記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

    <微生物全ゲノムシーケンス（PCR-free）>

    RNA量 1.5 µg以上
    濃度 10 ng/µL以上
    液量 20 µL以上
    純度 OD260/280 = 1.8 ~ 2.0
    DNAの分解、RNAのコンタミがないこと。

    ※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
    　記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

    ヒト全ゲノムシーケンス
    DNA 1 µg以上
    DIN値 7以上

    ※ Sample QC（Quality Check）の際に、Sampleを2-3 µL使用します。
    　 Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

    ヒト全エクソームシーケンス
    DNA量 0.5 µg以上
    DIN値 7以上

    <Twist Human Core Exomeの場合のみ>

    DNA量 0.05 µg以上
    DIN値 7以上

    ※ Sample QC（Quality Check）の際に、Sampleを2-3 µL使用します。
    　 Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

    動植物全ゲノムシーケンス

    <PCRありの場合>

    DNA量 0.1 µg以上
    DIN値 7以上

    <PCR Freeの場合>

    DNA量 1 µg以上
    DIN値 7以上

    ※ Sample QC（Quality Check）の際に、Sampleを2-3 µL使用します。
    　 Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

    16s/18s/ITSシーケンス
    RNA量 200 ng以上
    濃度 10 ng/µL以上
    液量 20 µL以上
    純度 OD260/280 = 1.8～2.0以上
    DNAの分解、RNAのコンタミがないこと。

    ※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
    　記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

    シャローショットガンメタゲノムシーケンス（SSMS）
    サンプルの状態 Genomic DNA
    サンプル量 200 ng以上
    濃度 10 ng/µL以上
    液量 20 µL以上
    純度 OD260/280 = 1.8～2.0
    サンプルの分解、RNAのコンタミがないこと

    ※ヒト/動物の消化器官系（GI）および糞便由来で、ホストのDNAの混入が50%以下のものに限る

    菌叢解析受託サービス メタゲノム

    ヒト・マウス等の糞便・唾液・皮膚・バイオプシ等から受託可能です。 精製済DNAからの場合は、Qubit測定でDNA濃度50 ng/uL以上,液量100uL以上で送付ください。
    これ以外のサンプルの場合はお問い合わせください。

    SheepMedical 菌叢解析受託サービス 16S rRNA解析 （V1＆V2領域）

    糞便・唾液・皮膚などから受託可能です。 糞便、唾液の場合は専用の輸送キットをガイドに従い採取いただき、 それ以外のサンプルの場合はお問い合わせください。

    ChIPシーケンス
    DNA量 50 ng以上
    濃度 2 ng/µL以上
    液量 15 µL以上
    純度 OD260/280 = 1.8 ~ 2.0
    DNAの分解、RNAのコンタミがないこと。

    ※本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
    　記載のサンプル量の2倍の量が推奨量となります。

    全ゲノムバイサルファイト
    シーケンス
    gDNA 0.2 µg以上
    DIN値 7以上

    ※ Sample QC（Quality Check）の際に、Sampleを2-3 µL使用します。
    　 Sample Volumeは、余裕をもってご準備ください。

  • ライブラリー調製済みサンプル

    ギガ読み（相乗りシーケンス）
    データ量≦ 20 G の場合 サンプル液量≥ 15 µL
    データ量20 G＜X≤100 Gの場合 サンプル液量 ≥ 25 µL
    データ量100 G＜X＜400 Gの場合 サンプル液量≥ 50 µL
    ライブラリー濃度 ≥2 ng /µL
    単一のメインピークで複数のピークがない、アダプターの汚染がない、プライマーダイマーがないこと

    レーンシーケンス
    （illumina HiSeq）
    濃度 5 nM以上
    液量 20 µL以上
    ライブラリーサイズ 320 bp～520 bp
    純度 単一のメインピークで複数のピークがないこと
    アダプターダイマーがないこと
    プライマーダイマーがないこと

    レーンシーケンス
    （illumina NextSeq500）
    濃度 5 nM以上
    液量 20 µL以上

    レーンシーケンス
    （illumina NovaSeq 6000）
    濃度 10 nM以上
    液量 20 µL以上
    ライブラリーサイズ 320 bp～520 bp
    純度 単一のメインピークで複数のピークがないこと
    アダプターダイマーがないこと
    プライマーダイマーがないこと

    レーンシーケンス
    （illumina MiSeq）
    サービスメニュー 濃度 液量 ライブラリーサイズ 純度
    MG-MILN-PE300 5 nM以上 20 µL以上 600 bp - 840 bp 単一メインピーク
    アダプターダイマーがないこと
    プライマーダイマーがないこと
    MG-MILN-PE150N 320 bp - 520 bp
    MG-MILN-PE250 520 bp - 720 bp
    MG-MILN-PE150M 320 bp - 520 bp

    illumina NovaSeq X
    シーケンスサービス
    濃度 10 nM以上
    液量 20 µL以上
    ライブラリーサイズ 320 bp～520 bp
    純度 単一のメインピークで複数のピークがないこと
    アダプターダイマーがないこと
    プライマーダイマーがないこと

    ＊1レーンでシーケンスするサンプルを、1チューブにプーリングしてご依頼ください。
    ＊ライブラリー調製からご依頼いただくことも可能です（別料金）。ご希望の場合はお問合せ下さい。

    ＊レーンシーケンスおよび、1/2&1/4レーンシーケンスで、送付いただくサンプルの詳細な注意点については、製品ページをご参照ください。

  • ロングリードシーケンス

    PacBio Sequel Ⅱ
    DNAサンプル

    ライブラリー調製に使用するKitをご確認の上、下記条件のDNAをご準備ください。
    GQNは40 kb以上を基準にしており、2.0の場合は全体の20％以上のDNAが40 kb以上であることを示します。

    ライブラリータイプ ライブラリー調製キット サンプルの状態 サンプル量 Average size（BP）
    PacBio Sequel Ⅱ Library HiFi(10kb - 25kb) gDNA 8.1 µg 25,000

    PacBio Sequel Ⅱ
    RNAサンプル
    ライブラリータイプ ライブラリー調製キット サンプルの状態 サンプル量 RIN rRNA ratio
    PacBio Sequel Library PacBio Sequel Iso-Seq Library Construction Total RNA 0.600 µg 7 1

    PacBio Sequel Ⅱe バクテリア全ゲノム
    シーケンス（相乗りプラン）

    ライブラリー調製に使用するKitをご確認の上、下記条件のDNAをご準備ください。
    GQNは40 kb以上を基準にしており、2.0の場合は全体の20％以上のDNAが40 kb以上であることを示します。

    ライブラリー調製キット サンプルの状態 サンプル量 Average size（BP）
    PacBio Sequel Microbial Library Construction gDNA 4.1 µg 20,000

    完全長16Sアンプリコンシーケンス（Full-Length 16S Amplicon Sequencing）

    ライブラリー調製に使用するKitをご確認の上、下記条件のDNAをご準備ください。
    GQNは40 kb以上を基準にしており、2.0の場合は全体の20％以上のDNAが40 kb以上であることを示します。

    サンプルの状態 サンプル量 濃度 液量 純度
    Genomic DNA 150 ng以上 10 ng/µL 以上 15 µL以上 OD260/280 = 1.8～2.0
    サンプルの分解、RNA・タンパク質のコンタミがないこと
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