Q

Endpoint Genotypingの解析を行ったときに表示されるScoreは、どのように計算された値ですか? また、Scoreの値に基準はありますか?

Endpoint Genotypingでは、以下の方法でScoreを計算します。

  • スタンダードを含む各サンプルにおいて、Scatter Plotでのその位置の角度を算出する。
  • すべての角度の分布がヒストグラムで描かれ(角度とこの角度のサンプル数)、分布曲線から曲線のピークが決まる。
  • 平均グループ角度が算出される。
  • 各サンプル角度の、平均グループ角度からの距離が、Scoreとして計算される。
  • スタンダードも平均グループ角度と比較されるため、スタンダードのScoreは必ずしも1.0にはならない。


また、Scoreは1に近いほど基準となるコントロール(平均グループ角度)と類似していると言えますが、具体的に「いくつ以上の数値だと信頼性が高い」というような基準等はありません。

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