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クリーンデータ(CatNo. NV-CLEAN)の詳細について、教えてください。

クリーンデータは、以下の作業を行います。

 

1)オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。

2)低質リード(Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード)の除去。

 ※Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。

3)塩基配列不明(N)が10%を超えるリードの除去。

 

クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。

クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。

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