Jackson Laboratoryのマウスジェノタイピングのプロトコールに「Kapa 2G HS」酵素の記載がありますが、使用している酵素は「KAPA 2G Fast HS」ですか。それとも「KAPA 2G Robust HS」ですか。
大変恐縮ではございますが、こちらのプロトコールはJackson Laboratoryが独自で記載しておおりますため、弊社では、どの製品かという正しい情報が確認できておりません。以前、本質問をメーカーのKAPA社にも確認しましたが、Jackson LaboratoryがKAPA 2G FastとKAPA 2G Robustの両製品を使用しているため、それぞれのプロトコールに関して、KAPA社でも製品特定ができないとのことでした。大変申し訳ございません。
解決策として、弊社からのご提案は下記の通りでございます。
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[ご提案]
① お客様自身でJackson Laboratoryにお問い合わせいただく。
② 「KAPA 2G Fast HS」または「KAPA 2G Robust HS」を用いて、Jackson Laboratoryのプロトコールで検討していただく。
※この2つの酵素でもうまく増幅しない可能性も否定できませんのでご注意ください。
※※弊社といたしましては、酵素としてGCリッチ配列にも強い「KAPA 2G Robust HS」でのご検討をお勧めします。
③ 「KAPA Mouse Genotyping Kit」を用いて、検討していただく。
キット：KAPA Mouse Genotyping Kit
商品URL：https://n-genetics.com/products/series/4412/
※※※最適化が必要です
最適化の方法ですが、Jackson Laboratoryと同様に「MgCl2を添加して、MgCl2濃度を最適化」「PCRサイクルは、タッチダウンを使用」を行うことをお勧めします。