SeqCap Epi デベロッパー エンリッチメントキット

(SeqCap Epi Developer Enrichment Kit)

ロシュ・ダイアグノスティックス株式会社

製品概要

SeqCap Epi Developer S Enrichment Kitは、
ヒト以外の生物種のゲノム上の任意の 30Mb までの領域 のメチル化バリエーションを評価するための試薬です。

SeqCap Epi Developer M Enrichment Kitは、
ヒト以外の生物種のゲノム上の任意の 30~60Mb の領域 のメチル化バリエーションを評価するための試薬です。

SeqCap Epi Developer L Enrichment Kitは、
ヒト以外の生物種のゲノム上の任意の 60~90Mb の領域 のメチル化バリエーションを評価するための試薬です。

SeqCap Epi Developer XL Enrichment Kitは、
任意の 90~210Mb の領域
のメチル化バリエーションを評価するための試薬です。

 

◆設計済みデザインをご利用の場合
SeqCap Epi Developer Enrichment Kit の各梱包サイズの製品番号に、 リファレンス番号を添えてご注文ください。

◆SeqCap Epi Developer S Enrichment Kit 新規デザインをご利用の場合
リファレンス配列のデータと、その中での位置情報をお知らせください。ターゲット領域として総計30Mb までの領域を指定してください。

◆SeqCap Epi Developer M Enrichment Kit 新規デザインをご利用の場合
リファレンス配列のデータと、その中での位置情報をお知らせください。ターゲット領域として総計30 ~ 60Mbの領域を指定してください。

◆SeqCap Epi Developer L Enrichment Kit 新規デザインをご利用の場合
リファレンス配列のデータと、その中での位置情報をお知らせください。ターゲット領域として総計 60 ~ 90 Mb の領域を指定してください。

◆SeqCap Epi Developer XL Enrichment Kit 新規デザインをご利用の場合
リファレンス配列のデータと、その中での位置情報をお知らせください。ターゲット領域として総計 90 ~ 210 Mb の領域を指定してください。


 

製品の特徴

・研究領域のフォーカス
ターゲット領域を研究対象領域のみに絞り込むことで、研究効率を上げることができます。次世代シークエンサーを利用したメチル化部位の解析ツールとして初 のカスタム試薬で、SeqCap Epi Choice S Enrichment Kit は ヒト 30Mb までの任意のターゲット領域を抽出することができます。


・両鎖を解析
バイサルファイト処理後にハイブリダイゼーションする独自のワークフローと、両鎖におけるメチル化の可能性を網羅したプローブデザインにより、両鎖の解析が可能です。それぞれのストランドでのメチル化状態の違いを検出できるほか、SNV との判別も可能です。

<想定される様々な組み合わせのプローブをプール> 1 本ごとのプローブ配列内の CpG サイトについて、どのようなメチル化のパターンでも確実に解析できるよう、想定される様々な組み合わせのプローブをプールしています。

< SNV との識別が可能> バイサルファイト変換を行ったDNAをシークエンスした場合、シークエンスリード上の T は、元のゲノム配列で「非メチル化 C 」を意味する他、「 SNV に由来した T 」である可能性が考えられます。両鎖を読むことで SNV を識別し、メチル化解析の正確性を向上させることができます。



インプット DNA の複雑性を保つワークフローにより重複リードの割合が抑えられ、シークエンスデータ量に対して効率的に解析をすることができます。

実験ワークフロー

SeqCap Epi システム 実験ワークフロー

シークエンスキャプチャー実験は、ライブラリ調製の工程とハイブリダイゼーションの工程に大別されます。

・ ライブラリは検体毎に調製する必要があります。ライブラリ調製工程で使用するキット は実験検体数分をご準備ください。ライブラリ調製時に SeqCap Adapter Kit B をご利用の場合には、ハイブリダイゼーションの工程で SeqCap HE-Oligo Kit B が必要となります。

・ ハイブリダイゼーション工程で使用するキットは、ハイブリダイゼーションの回数に応じてご準備ください。

・ SeqCap Epi システムはプレプール法には対応しておりません。

実験プロトコール

SeqCap Epi Enrichment System User's Guide
英語版PDF_Version 1.2
日本語版PDF_Version 1.0

使用事例

※SeqCapシリーズ製品の採用事例です。

Insights into beta cell regeneration for diabetes via integration of molecular landscapes in human insulinomas


参考サイト

◆ロシュ・ダイアグノスティックス株式会社
NimbleGen ターゲットエンリッチメントスペシャルサイトはこちら

 

関連動画

Cancer Research Challenge / がん研究におけるターゲットエンリッチメント・シークエンスとそのライブラリー調製(AACR 2017にて)

 

動画再生はこちらから


仕様

製品構成

・SeqCap Epi Enrichment Kit
・CD/DVD

 

保存温度

-15℃~-25℃

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納期/出荷日について

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月曜~金曜(土日祝日除く)14:30迄に販売店様よりご注文いただき弊社倉庫に在庫がある場合、基本的には当日出荷させていただきます。
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※冷凍品(-20℃)に関しては、原則として休前日(金曜日など)の出荷を行っておりませんのでご了承ください。(一部販売店様向けを除く)

CatNo.概要単位価格在庫
07139071001 SeqCap Epi Developer S Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の30Mbまでの領域 12反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
07139080001 SeqCap Epi Developer S Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の30Mbまでの領域 48反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
07139098001 SeqCap Epi Developer S Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の30Mbまでの領域 384反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
SeqCap Epi Developer M
07139101001 SeqCap Epi Developer M Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の30~60Mbまでの領域 12反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
07139128001 SeqCap Epi Developer M Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の30~60Mbまでの領域 48反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
07139578001 SeqCap Epi Developer M Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の30~60Mbまでの領域 384反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
SeqCap Epi Developer L
07139586001 SeqCap Epi Developer L Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の60~90Mbまでの領域 12反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
07139594001 SeqCap Epi Developer L Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の60~90Mbまでの領域 48反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
07139608001 SeqCap Epi Developer L Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の60~90Mbまでの領域 384反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
SeqCap Epi Developer XL
07139624001 SeqCap Epi Developer XL Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の90~210Mbまでの領域 12反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
07139659001 SeqCap Epi Developer XL Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の90~210Mbまでの領域 48反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可
07139667001 SeqCap Epi Developer XL Enrichment Kit ターゲットサイズ ヒト以外の生物種の任意の90~210Mbまでの領域 384反応 お問い合わせください 受注発注品 返品不可

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FAQ

使用方法・
技術的内容
調製したSeqCapライブラリ (Post-Capture LM-PCR産物) は、どの程度の期間安定性が保たれるのでしょうか。
冷凍で、一般的にPCR産物が保存できると考えられる期間は保存できます。(緊急に使用する必要性はありません)
この場合には凍結融解を繰り返さない様、充分に注意してください。

この製品に関するFAQ一覧

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