UPL ユニバーサルプローブライブラリー プローブ

(Universal ProbeLibrary Probes)

ロシュ・ダイアグノスティックス株式会社

製品概要

Universal ProbeLibrary Probes リアルタイムPCRによる遺伝子発現レベルを定量するための検証済みのプローブ (20μlで2×312回,50μlで2×125回用) アッセイ デザイン センターですぐにプライマーとプローブをデザインできます.

◆ UPL用プライマーの合成依頼は(株)日本遺伝子研究所でも承っております。
http://ngrl.co.jp/category1/dna/page_209

背景

ユニバーサルプローブライブラリーのプローブはLNA(ロックド核酸)と呼ばれるユニークなヌクレオチドケミストリーを使用し,8あるいは9塩基にプローブの長さを短縮させます.短いLNA PCRプローブは,リアルタイムPCRや一個のミスマッチの判別に要求される高い融解温度を維持しています.それゆえ,一般的なPCR条件と加水分解プローブ検出フォーマットに完全に適合します.ターゲットシークェンスの特異的増幅は,ProbeFinderソフトウェアでデザインされたプライマーを利用して獲得されます.無料のソフトウェアはユニバーサルプローブライブラリーアッセイデザインセンターで入手可能で,ターゲット遺伝子に対して一つ以上のイントロンを繋ぐアッセイがデザインできます.遺伝子に特異的な情報(遺伝子名,登録番号,シークェンス)を受け入れます.その後,ProbeFinderソフトウェアは特異的なプライマーと組み合わせてのユニバーサルプローブライブラリーのプローブを使用したアッセイをデザインします.

利点

  • アッセイデザインの時間と結果を得るまでの時間が大幅に短縮できます.
  • 高いアッセイの特異性,柔軟性,簡便性の組み合わせです.
  • 特別なハードウェアや反応条件は必要ありません.

製品の記述

本プローブはユニバーサルプローブライブラリーセット内の単品で,カバーされる生物種(ヒト,マウス,ラット,チンパンジー,線虫,ショウジョウバエ,シロイヌナズナ)のNCBIリファレンスシークェンスデータベースに含まれる遺伝子転写産物の約99%の遺伝子発現レベルを定量できます.プローブはレポーター蛍光色素(FAM)とダーククェンチャー色素で二重標識されています.これらは標準的なリアルタイムPCR機器での標準的リアルタイムPCRアッセイで使用します.

アプリケーション

NCBIリファレンスシークェンスデータベースに含まれるヒト,マウス,ラット,チンパンジー,線虫,ショウジョウバエ,シロイヌナズナのすべてのトランスクリプトームの遺伝子発現レベルの定量を迅速かつ柔軟に獲得するために,ライトサイクラーシステム2.0や他の一般的なリアルタイムPCR機器での,リアルタイムPCRアッセイでユニバーサルプローブライブラリーを使用します.ライトサイクラー2.0システムでのライトサイクラーTaqMan®マスター,あるいは他のリアルタイムPCRでのファストスタートTaqMan®プローブマスター(あるいは他のリアルタイムPCRに適合する試薬)を使用し,確立されたリアルタイムPCRプロトコールに従うことで,ユニバーサルプローブライブラリーセット,ヒトから選択されたプローブでアッセイを実行します.

アッセイデザインセンターで無料のウェブベースのProbeFinderソフトウェアを使用することで,遺伝子の特異的発現定量アッセイが簡単にデザインできます.

内 容

2バイアル,それぞれのバイアルには5'-フルオレセイン(FAM)と3'-ダーククェンチャー色素で標識された検証済みのプローブを125μl含みます.各バイアルは20μl反応で625回,50μl反応で250回のリアルタイムPCRアッセイ(ライトサイクラー2.0システム)に十分な量のプローブを含みます.

品 質

すべてのプローブは,ユニバーサルプローブライブラリーコントロールセット内のコントロールテンプレートとマッチングプライマーを使用したリアルタイムPCR検査に合格しています.各プローブは純度と品質が陰イオン交換HPLCとMALDI-MSで分析されています.

関連サイト

ユニバーサルプローブライブラリー(UPL)アッセイデザインセンター(英語)

仕様

保管温度冷凍 (-20℃)
毒劇なし

無料デモ・サンプル・その他お問い合わせはお気軽に

製品によってはサンプルのご用意が無い場合もございます。予めご了承ください。

お問い合わせ

オーダー情報

  • 在庫あり在庫あり(6個以上)
  • 在庫わずか在庫わずか(1~5個)
  • 販売中止販売中止
  • お問い合わせくださいお問い合わせください
  • 在庫無くなり次第販売中止 在庫無くなり次第販売中止
  • 受注発注品受注発注品
  • 別途送料請求あり 別途送料請求あり
  • 返品不可返品不可

納期/出荷日について

納期/出荷日について

月曜~金曜(土日祝日除く)14:30迄に販売店様よりご注文いただき弊社倉庫に在庫がある場合、基本的には当日出荷させていただきます。
弊社倉庫に在庫がない、もしくは何らかの事情で当日出荷ができない場合は、弊社よりご注文いただいた販売店様へ納期のご連絡をさせていただきます。
※冷凍品(-20℃)に関しては、原則として休前日(金曜日など)の出荷を行っておりませんのでご了承ください。(一部販売店様向けを除く)

CatNo.概要単位価格在庫
04684974001 Universal ProbeLibrary Probe 001(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04684982001 Universal ProbeLibrary Probe 002(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04685008001 Universal ProbeLibrary Probe 003(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04685016001 Universal ProbeLibrary Probe 004(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04685024001 Universal ProbeLibrary Probe 005(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04685032001 Universal ProbeLibrary Probe 006(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04685059001 Universal ProbeLibrary Probe 007(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04685067001 Universal ProbeLibrary Probe 008(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04685075001 Universal ProbeLibrary Probe 009(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04685091001 Universal ProbeLibrary Probe 010(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04685105001 Universal ProbeLibrary Probe 011(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04685113001 Universal ProbeLibrary Probe 012(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04685121001 Universal ProbeLibrary Probe 013(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04685130001 Universal ProbeLibrary Probe 014(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04685148001 Universal ProbeLibrary Probe 015(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04686896001 Universal ProbeLibrary Probe 016(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04686900001 Universal ProbeLibrary Probe 017(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04686918001 Universal ProbeLibrary Probe 018(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04686926001 Universal ProbeLibrary Probe 019(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04686934001 Universal ProbeLibrary Probe 020(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04686942001 Universal ProbeLibrary Probe 021(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04686969001 Universal ProbeLibrary Probe 022(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04686977001 Universal ProbeLibrary Probe 023(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04686985001 Universal ProbeLibrary Probe 024(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04686993001 Universal ProbeLibrary Probe 025(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687574001 Universal ProbeLibrary Probe 026(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04687582001 Universal ProbeLibrary Probe 027(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687604001 Universal ProbeLibrary Probe 028(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687612001 Universal ProbeLibrary Probe 029(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687639001 Universal ProbeLibrary Probe 030(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04687647001 Universal ProbeLibrary Probe 031(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687655001 Universal ProbeLibrary Probe 032(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687663001 Universal ProbeLibrary Probe 033(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04687671001 Universal ProbeLibrary Probe 034(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687680001 Universal ProbeLibrary Probe 035(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687949001 Universal ProbeLibrary Probe 036(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04687957001 Universal ProbeLibrary Probe 037(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04687965001 Universal ProbeLibrary Probe 038(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04687973001 Universal ProbeLibrary Probe 039(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04687990001 Universal ProbeLibrary Probe 040(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688007001 Universal ProbeLibrary Probe 041(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688015001 Universal ProbeLibrary Probe 042(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688031001 Universal ProbeLibrary Probe 043(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688040001 Universal ProbeLibrary Probe 044(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688058001 Universal ProbeLibrary Probe 045(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688066001 Universal ProbeLibrary Probe 046(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688074001 Universal ProbeLibrary Probe 047(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688082001 Universal ProbeLibrary Probe 048(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688104001 Universal ProbeLibrary Probe 049(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688112001 Universal ProbeLibrary Probe 050(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688481001 Universal ProbeLibrary Probe 051(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688490001 Universal ProbeLibrary Probe 052(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688503001 Universal ProbeLibrary Probe 053(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688511001 Universal ProbeLibrary Probe 054(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688520001 Universal ProbeLibrary Probe 055(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688538001 Universal ProbeLibrary Probe 056(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688546001 Universal ProbeLibrary Probe 057(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688554001 Universal ProbeLibrary Probe 058(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688562001 Universal ProbeLibrary Probe 059(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04688589001 Universal ProbeLibrary Probe 060(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688597001 Universal ProbeLibrary Probe 061(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688619001 Universal ProbeLibrary Probe 062(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688627001 Universal ProbeLibrary Probe 063(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688635001 Universal ProbeLibrary Probe 064(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688643001 Universal ProbeLibrary Probe 065(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688651001 Universal ProbeLibrary Probe 066(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688660001 Universal ProbeLibrary Probe 067(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688678001 Universal ProbeLibrary Probe 068(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688686001 Universal ProbeLibrary Probe 069(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688937001 Universal ProbeLibrary Probe 070(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688945001 Universal ProbeLibrary Probe 071(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688953001 Universal ProbeLibrary Probe 072(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688961001 Universal ProbeLibrary Probe 073(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688970001 Universal ProbeLibrary Probe 074(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04688988001 Universal ProbeLibrary Probe 075(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04688996001 Universal ProbeLibrary Probe 076(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689003001 Universal ProbeLibrary Probe 077(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689011001 Universal ProbeLibrary Probe 078(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689020001 Universal ProbeLibrary Probe 079(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689038001 Universal ProbeLibrary Probe 080(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689046001 Universal ProbeLibrary Probe 081(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689054001 Universal ProbeLibrary Probe 082(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689062001 Universal ProbeLibrary Probe 083(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689089001 Universal ProbeLibrary Probe 084(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689097001 Universal ProbeLibrary Probe 085(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689119001 Universal ProbeLibrary Probe 086(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689127001 Universal ProbeLibrary Probe 087(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689135001 Universal ProbeLibrary Probe 088(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04689143001 Universal ProbeLibrary Probe 089(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04689151001 Universal ProbeLibrary Probe 090(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04692080001 Universal ProbeLibrary Probe 091(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04692098001 Universal ProbeLibrary Probe 092(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04692101001 Universal ProbeLibrary Probe 093(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04692110001 Universal ProbeLibrary Probe 094(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04692128001 Universal ProbeLibrary Probe 095(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04692136001 Universal ProbeLibrary Probe 096(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04692144001 Universal ProbeLibrary Probe 097(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04692152001 Universal ProbeLibrary Probe 098(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04692179001 Universal ProbeLibrary Probe 099(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04692187001 Universal ProbeLibrary Probe 100(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04692195001 Universal ProbeLibrary Probe 101(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04692209001 Universal ProbeLibrary Probe 102(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04692217001 Universal ProbeLibrary Probe 103(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04692225001 Universal ProbeLibrary Probe 104(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04692241001 Universal ProbeLibrary Probe 105(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04692250001 Universal ProbeLibrary Probe 106(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04692268001 Universal ProbeLibrary Probe 107(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04692276001 Universal ProbeLibrary Probe 108(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04692284001 Universal ProbeLibrary Probe 109(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04692306001 Universal ProbeLibrary Probe 110(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04693442001 Universal ProbeLibrary Probe 111(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693469001 Universal ProbeLibrary Probe 112(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04693477001 Universal ProbeLibrary Probe 113(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04693485001 Universal ProbeLibrary Probe 114(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04693493001 Universal ProbeLibrary Probe 115(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか
04693507001 Universal ProbeLibrary Probe 116(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693515001 Universal ProbeLibrary Probe 117(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693523001 Universal ProbeLibrary Probe 118(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693531001 Universal ProbeLibrary Probe 119(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04693540001 Universal ProbeLibrary Probe 120(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04693558001 Universal ProbeLibrary Probe 121(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04693566001 Universal ProbeLibrary Probe 122(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693574001 Universal ProbeLibrary Probe 123(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04693582001 Universal ProbeLibrary Probe 124(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693604001 Universal ProbeLibrary Probe 125(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04693612001 Universal ProbeLibrary Probe 126(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04693639001 Universal ProbeLibrary Probe 127(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693647001 Universal ProbeLibrary Probe 128(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693655001 Universal ProbeLibrary Probe 129(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04693663001 Universal ProbeLibrary Probe 130(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694155001 Universal ProbeLibrary Probe 131(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694163001 Universal ProbeLibrary Probe 132(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694171001 Universal ProbeLibrary Probe 133(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694180001 Universal ProbeLibrary Probe 134(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694198001 Universal ProbeLibrary Probe 135(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694201001 Universal ProbeLibrary Probe 136(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694210001 Universal ProbeLibrary Probe 137(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694228001 Universal ProbeLibrary Probe 138(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694236001 Universal ProbeLibrary Probe 139(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694244001 Universal ProbeLibrary Probe 140(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694279001 Universal ProbeLibrary Probe 141(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694287001 Universal ProbeLibrary Probe 142(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694295001 Universal ProbeLibrary Probe 143(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694309001 Universal ProbeLibrary Probe 144(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694317001 Universal ProbeLibrary Probe 145(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694325001 Universal ProbeLibrary Probe 146(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694333001 Universal ProbeLibrary Probe 147(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694341001 Universal ProbeLibrary Probe 148(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694350001 Universal ProbeLibrary Probe 149(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694368001 Universal ProbeLibrary Probe 150(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください
04694376001 Universal ProbeLibrary Probe 151(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694384001 Universal ProbeLibrary Probe 152(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694392001 Universal ProbeLibrary Probe 153(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694406001 Universal ProbeLibrary Probe 154(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694414001 Universal ProbeLibrary Probe 155(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694422001 Universal ProbeLibrary Probe 156(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694449001 Universal ProbeLibrary Probe 157(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694457001 Universal ProbeLibrary Probe 158(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694465001 Universal ProbeLibrary Probe 159(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694473001 Universal ProbeLibrary Probe 160(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694481001 Universal ProbeLibrary Probe 161(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694490001 Universal ProbeLibrary Probe 162(2x125ul) 2x312 reactions 在庫わずか 受注発注品 返品不可
04694503001 Universal ProbeLibrary Probe 163(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694511001 Universal ProbeLibrary Probe 164(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可
04694520001 Universal ProbeLibrary Probe 165(2x125ul) 2x312 reactions お問い合わせください 受注発注品 返品不可

無料デモ・サンプル・その他お問い合わせはお気軽に

製品によってはサンプルのご用意が無い場合もございます。予めご了承ください。

お問い合わせ

FAQ

使用方法・
技術的内容

あるターゲット遺伝子をUPLによる蛍光プローブ法でリアルタイムPCR定量したいと考えています。

UPLは165種類あるようですが、どの番号のプローブを使用すればよいのでしょうか?

UPLは、特定のターゲットに対して配列デザインをするのではなく、既にそれぞれ特異的な
配列を持つ165種類のUPLがデザインされております。
理論上、165種類のUPLプローブで約7,000の転写産物に結合サイトを持ちます。
(逆に、各転写産物は約16種類のUPLプローブと結合する確率となります。)


ターゲット遺伝子(配列)に対して使用するプライマーとUPLプローブのセットは、
下記のProbe Finder (Assay Design Center)で無償でデザインいただけます。
UPLの場合、プライマー配列とセットでデザインすることで、その特異性を担保いたします。


【無償のUPLデザインサイト】
Probe Finder(下記のページ中のAssay Design Centerのタブになります)
https://lifescience.roche.com/global_en/brands/universal-probe-library.html


 *こちらの検索にはInternet Explorerが推奨されております。
 また、デザイン結果が以前のものと異なる場合は、念のため、キャッシュをクリアください。
*日本語のアッセイデザインガイドもご参照ください。
 https://www.n-genetics.com/products/1295/1023/13948.pdf


【プライマーとUPLのご注文について】
上記デザインサイトでデザインいただいたプライマーは、通常のプライマーと同様にオリゴ合成受託サービス会社で
ご準備ください。
弊社では株式会社日本遺伝子研究所をお勧めしております。
http://ngrl.co.jp/
また、UPLにつきましては、表示されたプローブ番号を弊社のUPL製品ページにてご確認ください。


【補足:UPLの配列情報について】
UPLの各プローブの配列は、企業ノウハウのため、リストとしては公開されておりません。
もしも論文等に掲載いただく場合には、製品名、メーカー名とともにProbe番号を掲載いただければ、配列情報を
記載しなくても問題はございません。
なお、上記のProbe Finderでデザインいただいた際に、WEB上で配列をZoomしますと、ピックアップされた
UPL番号の結合部位の配列情報を見ることができます。


 

使用方法・
技術的内容

現在所有しているプライマーセットの情報から使用可能なUPLプローブ番号を検索したいのですが、

検索方法を教えてください。

UPLは下記のProbe Finder (Assay Design Center)で無償でデザインいただけます。
このとき、プライマーもセットで自動でデザインされます。
このように基本的には「ターゲットの遺伝子情報からプライマーとプローブをセットでデザインする」
仕様のため、もともと「プライマー情報から使用可能なプローブを検索する」仕様となっておりません。
ただ、この場合にお試しいただける方法はございますため、下記にご説明させていただきました。

【無償のUPLデザインサイト】
Probe Finder(下記のページ中のAssay Design Centerのタブになります)
https://lifescience.roche.com/global_en/brands/universal-probe-library.html

*こちらの検索にはInternet Explorerが推奨されております。
また、デザイン結果が以前のものと異なる場合は、念のため、キャッシュをクリアください。
*日本語のアッセイデザインガイドもご参照ください。
https://www.n-genetics.com/products/1295/1023/13948.pdf


【補足情報:UPLについて】
UPLは、特定のターゲットに対して配列デザインをするのではなく、既にそれぞれ特異的な
配列を持つ165種類のUPLがデザインされております。
理論上、165種類のUPLプローブで約7,000の転写産物に結合サイトを持ちます。
(逆に、各転写産物は約16種類のUPLプローブと結合する確率となります。)

UPLの各プローブの配列は、企業ノウハウのため、リストとしては公開されておりません。
そのため、上記のProbe Finderで「生物種」+「遺伝子」や、ダイレクトにターゲットの配列情報を
入力してデザインすると、その配列に結合できるUPLのProbe番号がピックアップされます。
更にそれを挟むプライマー配列も自動でデザインされて、セットで候補としてリストされます。
(UPLの場合、プライマー配列とセットでデザインすることで、その特異性を担保いたします。)
なお、このときに、WEB上で配列をZoomすることで、ピックアップされたUPLが結合する
サイトの配列情報を見ることができます。

【プライマー情報からプローブを検索する方法について】
もしもお試しいただくとしますと、配列情報で検索する方法です。
まずは、アッセイデザインセンターで「生物種」をご選択いただくと、
「By sequence ID, gene name or keyword」あるいは「by Sequence」の検索画面が表示されます。
「by Sequence」のほうで、今回のプライマー配列を含むアンプリコン全配列をコピーペーストで
入力ください。
入力欄の下の「Automatically select an intron spanning assay.」のチェックを外してから
「Design」をクリックください。
これで、プライマーとプローブがデザインされれば、そのままご使用いただけると存じます。
(プライマーの位置はアンプリコンの内側にずれてデザインされる可能性もございます。)

*もしもこの方法で「No assays could be designed.」と表示された場合*
その下に更に「No matching probes found.」と表示されてしまいますと、残念ながら、そのプライマーに
挟まれた領域には、該当するUPLが含まれていないことを意味いたしますため、残念ながら
そのプライマーセットはUPLではご使用いただけません。


もしも「No matching probes found.」の表示がなければ、該当するプローブがあっても、このソフトの
アルゴリズムではプライマーがデザインできないことを意味します。
あまりお勧めはできないのですが、アンプリコンの上流や下流の配列を追加しながら再検索ください。
新たなプライマー配列がデザインできれば、プローブ番号と共に表示されます。
そのプローブが、お持ちのプライマー配列に挟まれていれば、ご使用いただける可能性がございます。
(あるいは、あらたなプライマー配列もご検討の候補になるかと存じます。)

この製品に関するFAQ一覧

レビュー

レビューはまだ投稿されていません。投稿をお待ちしております。

レビューを書く

この製品に関するお問合せはこちら

各項目を入力していただき、入力が終わりましたら入力内容の確認ボタンを押してください。
*の付いた項目は必ずご入力をお願い致します。

ページトップへ