事前にパルスフィールド電気泳動でサイズ確認して、Blue Pippinを使用しています。 サンプルのサイズ・量と泳動条件を揃えて抽出しても、 回収量が大きく変動することがありますが、その場合はどのような原因が考えらえますか？

一般的に回収量が大きく振れる原因は、主に下記の２つの要因が考えられます。

 

　① 回収時のバラつき：DNAは溶出ウェルの最終膜（限外ろ過膜）でトラップされます。

　　　　　　　　　　　回収時にピペッティング等で膜から遊離させますが、この時に回収率がバラつき易いです。

 

　② 泳動中のバラつき：基本原理がアガロース電気泳動ですので、原理上環境条件やサンプル中の電荷物質などの諸要因で、

　　　　　　　　　　　Runバッチ間の移動度のバラつきが生じ易いです。

　　　　　　　　　　　特に長鎖の場合や長時間の電気泳動では、レーン間の移動度のバラつきが大きくなります。