測定に8連チューブを使用する際、取扱い説明書には空チューブをセットするように記載されています。 この理由はなんでしょうか？

セット時に機器上部から圧力がかかる設計の為、空チューブを設置する事で均等に圧力を掛けるようにするためです。

取扱い説明書を参考に、端の列等に空チューブを設置するのが推奨となります。